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基于Label Free的定量蛋白组分析

基于Label Free的定量蛋白组分析

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的定量蛋白组学研究技术都是首先标记蛋白然后利用质谱进行分析;尽管提供的蛋白定量信息量巨大,但是标记试剂比较昂贵,每一个样品的成本较大,因此比较适合在整个蛋白组水平上对蛋白的表达变化进行定量的分析;对于相对简单的蛋白混合物,比如说co-IP的样品来说,投入产出比比较低;对于某些翻译后修饰方式的蛋白组学研究来说,比如泛素化研究,本身泛素化就是发生在赖氨酸上侧链上,对于泛素化肽段的富集是利用针对赖氨酸侧链上残留的两个甘氨酸(gly-gly)的抗体来实现的,但是iTRAQ试剂的标记会对此富集过程产生很大的影响,因此就不能使用iTRAQ标记技术对组织样品的泛素化修饰进行组学水平上的分析。Label Free定量分析技术就是基于此实验需求建立起来的定量蛋白组学技术。 同一个肽段在质谱分析过程中离子化效率相同,质谱峰的面积就直接代表了该肽段量的多少,因此可以直接通过比较同一肽段质谱峰面积的方法直接得到该肽段所代表的蛋白的相对定量信息。

百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台,Orbitrap Fusion质谱平台,Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,推出基于Label Free的定量蛋白组分析服务技术包裹,您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

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